微生物實(shí)驗室如果從事致病菌檢測、培養(yǎng)基質(zhì)控驗收、方法驗證等相關(guān)工作，就應(yīng)該備有質(zhì)控菌株。實(shí)驗室需對使用的質(zhì)控菌株進(jìn)行規(guī)范性管理，以便有效地、安全地使用，保證實(shí)驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。
首先、實(shí)驗室應(yīng)制定菌種管理制度
內(nèi)容包括菌種申購、保管、領(lǐng)用、使用、傳代、存儲等方面的內(nèi)容，質(zhì)控菌種申購應(yīng)由專人申購，保管由專人雙人雙鎖管理，領(lǐng)用及使用應(yīng)填寫記錄，使用時應(yīng)對菌種進(jìn)行純度及生化特性進(jìn)行菌種核查驗證并記錄，存儲應(yīng)有專門的冰箱、超低溫冰箱進(jìn)行存儲，使用完的菌株應(yīng)按要求銷毀處理。
第二、實(shí)驗室可根據(jù)需求購買相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)菌株或商業(yè)派生菌株作為質(zhì)控菌株
實(shí)驗室用質(zhì)控菌種一般來自認(rèn)可的國內(nèi)或國外菌種保藏機(jī)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)控菌株，或與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株。要求包裝可靠，采集迅速，不泄漏不污染。保證菌種合格和環(huán)境安全。因此，需選擇有資質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)菌株的合格供應(yīng)商，每批標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)控菌株必須附帶有供應(yīng)商的菌種質(zhì)量證明證、檢測報告、說明書等，來證明所采購的標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)控菌株是合格的。收到菌種時應(yīng)仔細(xì)閱讀菌種證明，核實(shí)到貨的菌種與申購的是否一致，包裝是否完整，注意保存條件及有效期，并將菌種放置相應(yīng)的條件下進(jìn)行儲存（一般在活化前儲存于4℃冰箱中）。核實(shí)后及時填寫菌種清單，菌種清單應(yīng)包括菌種名稱、菌種編號、到貨日期、儲存條件、購買數(shù)量、領(lǐng)用日期、領(lǐng)用人、銷毀日期等。
第三、實(shí)驗室需對標(biāo)準(zhǔn)菌種活化、確認(rèn)、傳代保藏、使用、銷毀進(jìn)行記錄。
記錄內(nèi)容包括質(zhì)控菌種名稱、菌種編號、到貨日期、菌種完整性、菌種活化日期、活化方法（主要包括活化使用的培養(yǎng)基及培養(yǎng)溫度）、活化數(shù)量、確認(rèn)方法結(jié)果、保藏條件，保存數(shù)量、領(lǐng)用人、傳代日期、傳代數(shù)量、菌種用途、銷毀日期等。菌種確認(rèn)是在活化后對菌株純度、菌落形態(tài)（在選擇培養(yǎng)基上的典型菌落）、生化特性（如氧化酶試驗、三糖鐵試驗等）、表型分析（生化鑒定）進(jìn)行核查并記錄，以保證菌種使用的有效性。
菌種保藏方法可依據(jù)標(biāo)準(zhǔn)SN/T2660-2010《食品微生物實(shí)驗室菌種保藏方法》進(jìn)行保存。建議實(shí)驗室購買-80℃超低溫冰箱，選擇甘油保存法或瓷珠菌種保存管，瓷珠菌種保存管方法操作方便，保存時間較長。菌株使用過程中應(yīng)在生物安全柜中進(jìn)行，遵循無菌操作以防質(zhì)控菌種污染。使用完的菌種應(yīng)按生物安全要求，在121℃高壓滅菌30min，并做好菌種銷毀記錄。
